भूटान भी अंग्रेजांे के प्रति सजग था। लार्ड ड्लहौजी ने जैनकिन्स को भूटानी सीमा का इन्चार्ज नियुक्त किया था परंतु भूटानियों ने गोळपाड़ा,कूचबिहार तथा रंगपुर क्षेत्र में सीमा अतिक्रमणों का प्रत्युत्तर दिया था। ये सीमान्त छेड़छाड़ आगे भी चलती रही। यह बाद में 1864 में ईडन मिशन के साथ हुई वार्ताळाप से स्पष्ट होती है जिसमें एक हिन्दुस्तानी तोन्गशू पैनलों द्वारा दिल्ली, लौहार, नेपाल के शासकों द्वारा भूटान सरकार से अंग्रेजों को खदेडने के लिए सहायता माँगी थी।